460 papers
Dit artikel introduceert TaxonMatch, een hulpmiddel dat taxonomische data uit diverse bronnen zoals GBIF, NCBI en iNaturalist integreert door namen te aligneren, synoniemen op te lossen en inconsistenties te corrigeren, waardoor een coherente taxonomische achtergrond voor biodiversiteitsonderzoek ontstaat.
Dit onderzoek toont aan dat snelle evolutie van het muis-speekselproteïneprofiel, met name in de submandibulaire klier en met sterke seksuele dimorfie, wordt gedreven door lijn-specifieke genexpansie en regulatoire herschikkingen, zoals de uitbreiding van de kallikrein-gencluster en testosteron-geassocieerde regulatiemotieven.
Uit dit experimenteel onderzoek blijkt dat de evolutionaire geschiedenis van symbiose met Paraburkolderia-bacteriën de latere evolutionaire trajecten van de gastheer-amoeba Dictyostelium discoideum beïnvloedt, zelfs nadat de symbiont is verwijderd.
De studie toont aan dat gekoppelde selectie de nucleotide-diversiteit in grote stekelbaarspopulaties beïnvloedt, terwijl een van de kleine zoetwaterpopulaties, zoals voorspeld door de theorie, een verhoogde recombinatiesnelheid heeft ontwikkeld om aanpassing te faciliteren.
Dit onderzoek toont aan dat, hoewel intrinsieke informatiebronnen zoals mechanische stress en celdouderdom de evolutie van meercelligheid kunnen faciliteren, ze fundamenteel beperkt zijn in hun vermogen om zowel soepele als nauwkeurig gereguleerde levenscycli te produceren.
Dit onderzoek toont aan dat de vergrijzing van de wereldbevolking tussen 2017 en 2050 de virulentie en sterfte door specifieke ziekten zoals Ebola, mazelen en tuberculose in bepaalde regio's zal verhogen, terwijl deze in andere scenario's door de kortere infectieduur bij ouderen juist zal dalen.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie van SARS-CoV-2 wordt gedreven door een dynamisch armsrace tussen virale aanpassing en menselijke immuniteit, waarbij de selectiedruk verschuift van ACE2-binding naar het ontvluchten van specifieke antilichaamklassen naarmate de bevolkingsimmuniteit toeneemt.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie van landdieren mogelijk werd gemaakt doordat genen die overbleven na een oude gehele-genoomverdubbeling werden hergebruikt en aangepast om de extreme fysiologische aanpassingen voor het leven aan land, zoals de estivatie bij longvissen, te ondersteunen.
Ondanks dat *Arabidopsis thaliana* zich zelf bevrucht, wordt de evolutie van de bloemgrootte over het verspreidingsgebied heen bepaald door lokale trade-offs tussen omgevingsstress en zaadproductie, waarbij strenge selectie aan de klimaatranden kleinere bloemen bevordert terwijl in gunstiger habitats zowel kleine als grote bloemen kunnen ontstaan.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutionaire convergentie naar kleinere bloemblaadjes bij zelfbevruchtende Brassicaceae-soorten wordt gedreven door de specifieke architectuur van het ontwikkelingsnetwerk rond het JAG-geen en het behoud van functionele variatie, wat evolutionaire trajecten voorspelbaar maakt.
Dit onderzoek toont aan dat de seizoensgebonden timing van epidemieën een evoluerend levenskarakteristiek is waarbij pathogenen, afhankelijk van de transmissiekracht, kunnen uitwijken naar een stabiele aanpassing aan een specifiek seizoen, een continue fenologische verschuiving of een coëxistentie van meerdere seizoensvormen.
Dit onderzoek toont aan dat het omwisselen van afhankelijke en onafhankelijke variabelen in PGLS-regressies onder Pagel's lambda-model tot inconsistente conclusies kan leiden, en identificeert Pagel's lambda en Blomberg's K als de meest betrouwbare criteria om de afhankelijke variabele te selecteren wanneer de causale richting onduidelijk is.
Deze studie identificeert een nieuwe, in drie varianten voorkomende zelfzuchtige DNA-sequentie in *C. elegans*, waarbij de standaardstam N2 een actieve toxine-allel bezit dat door endogene piRNA- en 22G-siRNA-padwegen wordt onderdrukt, wat het eerste natuurlijk voorkomende voorbeeld is van een niet-gekoppeld toxine-antidotesysteem dat via post-transcriptionele silencing wordt gereguleerd.
Deze studie toont aan dat imprinted genen in *Arabidopsis lyrata* en de Brassicaceae-familie voornamelijk onder purificerende selectie staan met tekenen van balancerende selectie in uitcrossende populaties, terwijl de mate van ouderlijk conflict en co-evolutie tussen deze genen complexer is dan de kinship-theorie voorspelt.
Hoewel hemagglutinine van verschillende influenza A-subtypen een zeer vergelijkbare structuur en functie delen, vertonen ze aanzienlijk verschillende evolutionaire beperkingen op aminozaatsniveau, waarbij ongeveer de helft van de posities sterk uiteenlopende voorkeuren voor aminozuren heeft die worden beïnvloed door de specifieke interacties binnen de subtypen.
Deze studie toont aan dat bij 29 drosophilid-vliegensoorten eiergrootte negatief allometrisch schaalt met lichaamsgrootte en dat de evolutie van eimorfologie het beste wordt beschreven door geleidelijke, stochastische verandering, wat verschilt van patronen in andere diergroepen.
Dit onderzoek onthult hoe de evolutionaire overgang van een actieve archaeale RNase naar een regulatoir hub in de eukaryotische RNA-exosoom een allosterisch mechanisme behield dat de coördinatie van opeenvolgende RNase-activiteiten mogelijk maakt.
Dit onderzoek toont aan dat structurele reorganisatie en genomische context, naast sequentievariatie, een nieuwe, divergente lijn van het Wolbachia-manendodende gen wmk definiëren, waarvan de verspreiding wordt beperkt door de symbiont-supergroep en de taxonomische orde van de gastheer.
Deze studie toont aan dat de diversificatie in netwerken met zowel mutualistische als antagonistische interacties sterk afhangt van de manier waarop deze interacties gekoppeld zijn aan dezelfde of verschillende plantentrekken, waarbij 'ecologische pleiotropie' de evolutiedynamiek in alle betrokken groepen interdependent maakt.
Deze studie introduceert een eenvoudige test die aantoont dat de sequentie van vele accessoire genen bij *Escherichia coli* en *Staphylococcus aureus* geconserveerd is, wat bewijst dat ten minste 75% van deze genen adaptief is en door natuurlijke selectie in stand wordt gehouden.